INFORMATII GENERALE

TITLU PROIECT: “Hematopoieza Clonala in Cancerul de Pancreas – Zgomot Biologic sau Semnificatie Clinica Importanta?”

COD PROIECT: PN-III-P1-1.1-PD-2021-0759

Nr. Contract:  PD113/2022

 Acronim: HIPNOSE

Autoritatea de finantare: Unitatea Executiva pentru finantarea Invatamantului Superior, a Cercetarii, Dezvoltarii si Inovarii (UEFISCDI) Programul 1 – Dezvoltarea sistemului national de cercetare-dezvoltare. Proiecte de Cercetare Postdoctorala (PD)

Director de proiect: Dr. Cazacu Irina Mihaela

Coordonator: Institutul Clinic Fundeni

Durata proiectului: 24 luni, 01/04/2022-31.03.2024

Valoarea totala: 250.000 RON

OBIECTIV GENERAL

Odată cu utilizarea crescută a secvențierii genetice pentru a ghida deciziile clinice în oncologie, posibilitatea identificării hematopoiezei clonale (HC) în cadrul analizei genomice este din ce în ce mai probabilă. Scopul principal al proiectului de cercetare HIPNOSE este evaluarea prezenței mutațiilor legate de HC în genele relevante pentru adenocarcinomul ductal pancreatic (PDAC) în ADN-ul liber circulant și țesutul tumoral de la pacienții cu PDAC local avansat și metastatic. Proiectul HIPNOSE isi propune de asemenea evaluarea impactului mutatiilor de HC asupra interpretarii rezultatelor de biopsie lichidă / secvențierea tumorii. Aceeași platformă NGS țintită  va fi aplicată pe toate cele trei surse de ADN pentru a detecta mutații de HC în probele de țesut, plasmă și celule sanguine periferice (PBC) corespunzătoare. Mutațiile detectate din PBC vor fi clasificate ca mutații legate de HC. Vom aplica apoi aceeași platformă NGS țintită pe eșantioane PBC ale unui grup de control alcatuit din indivizi sanatosi pentru a determina dacă aceste variante au semnificație funcțională sau reprezintă zgomot biologic. O cohortă de pacienți cu PDAC local avansat / metastatic va fi alcatuită prospectiv și utilizată pentru validarea mutațiilor identificate anterior utilizând digital droplet PCR. 

EN – GENERAL INFORMATION

Project TITLE “Clonal Hematopoiesis in Pancreatic Cancer – Biological Noise or Valuable Clinical Information?”

Project CODE: PN-III-P1-1.1-PD-2021-0759

Contract No. PD113/2022

Acronim: HIPNOSE

Contracting Authority: Executive Unit for Financing Higher Education, Research, Development and Innovation (UEFISCDI)

Project Leader: Dr. Cazacu Irina

Coordinator: Fundeni Clinical Institute

Project Duration: 24 months, 01/04/2022-31.03.2024

Total budget: 250.000 RON

MAIN OBJECTIVE

With the increased use of genetic sequencing to inform clinical decision-making in oncology, the possibility of identifying clonal hematopoiesis (CH) in the setting of genomic analysis is increasingly likely. The major aim of the HIPNOSE proposal is to evaluate the presence of CH-related mutations in genes relevant for pancreatic ductal adenocarcinoma (PDAC) in plasma cfDNA and tumor tissues from patients with locally advanced and metastatic PDAC and to evaluate the clinical significance of CH-related mutations on the interpretation of liquid biopsy/tumor sequencing results. The same ultradeep targeted NGS platform will be applied across all three sources of DNA to detect mutations with low variant allele frequency in the corresponding tissue, plasma, and peripheral blood cells (PBC) samples. Mutations detected from PBCs will be categorized as CH-related mutations. We will then apply the same ultradeep targeted NGS platform on PBC samples from healthy controls matched by age and gender to determine if those variants have functional significance or they represent biological noise. A cohort of locally advanced/metastatic PDAC patients will be prospectively set-up and used for validation of the previously identified mutations using digital droplet PCR.